V samostanu je bila leta 1752 ustanovljena tudi knjižnica, ki pa je bila med drugo svetovno vojno, leta 1944, skupaj s samostanom precej poškodovana. Ob tem je bil uničen dobršen del dragocenih knjig, ostale pa so bile več desetletij neustrezno hranjene. Nekaj knjig se je ohranilo in so dobile mesto v prenovljeni samostanski knjižnici v vzhodnem delu samostana.
Knjižnica se ponaša z nekaterimi redkimi eksponati: rokopisi na pergamentu iz 11. in 12. stoletja, prevodom evangelijev Primoža Trubarja iz leta 1557 in dvema Dalmatinovima Biblijama iz leta 1584. Zbirka je odprta za javnost.